《异形契约》的故事发生在《普罗米修斯》10年后，一群新的宇航员乘坐着“契约号”飞船前往遥远的星系寻找殖民地，他们来到一处看似天堂般的星球，实则是黑暗、危险的地狱，在那里他们见到了“普罗米修斯”号唯一的幸存者——仿生人大卫，一场毁灭性的巨大灾难即将到来。

大卫和沃尔特都是仿生人(机器人，身体与人类类似)。

而大卫是Weyland造的第一代生化智能人，拥有非常高的智能水平，能够自己学习新知识，还被允许创造和思考。最后大卫自我进化到了非常高的水平，开始对生命进行思考，认为人类是已经过时的苟延残喘的物种，只有像他这样的智能人才是未来，所以他主张消灭人类消灭工程师。

沃尔特则是后续升级版本的仿生人，人类发现给仿生人太多创造和思考的权限会让仿生人产生自我意识，于是就在大卫后续的仿生人版本禁止了生化人创造的能力。所以大卫在思考和创造方面是要比沃尔特高级，具有自己进化的能力。

大卫认为自己比普通人类更厉害，人类应该被淘汰了。在他见到工程师，也就是人类的造物主之后，感觉工程师也不过是有限定生命的生物，也并不比人类高级多少，于是感觉工程师也是要被淘汰的物种，他，人工智能才是未来。

在《异形契约》，大卫忽悠沃尔特加入他一起消灭人类的时候，沃尔特没有同意，于是他俩就开撕。大卫用笛子捅了沃尔特脖子一下，当时镜头是沃特鼻子在流出白色的液体，但给了个脖子的特写伤口自动愈合了。后面大卫在和女主搏斗时沃特突然出现救下女主，沃特也说了自己没死是因为自己是升级版的生化人，具有自动修复的能力，战斗力更高。于是大卫打不过沃特，被按在地上摩擦摩擦。但这时大卫手在地上抓到一把刀。然后镜头结束，留了个悬念。

结尾部分，仿生人回答不了女主的湖边小屋提问，露馅了，女主此时才知道带上飞船的是大卫，但为时已晚，她已经进入冻眠舱，到底女主有没有死呢?这个谁也不知道，就得等下一部了