《仙剑奇侠传》初代的剧情发生在三代的五十年后。

一心习武梦想名震江湖的李逍遥，在机缘巧合下结识神秘少女赵灵儿，展开护卫佳人千里寻母的旅程。途中因为多管闲事，得罪了欢喜冤家林月如，又被苗族巫女阿奴死缠不放。面对蕙质兰心的赵灵儿、外刚内柔的林月如、烂漫天真的阿奴，他将要如何抉择呢？

仙剑奇侠传二》的剧情发生在初代的八年后。

道消：仙剑新掌门李逍遥，武功天下第一，御剑行侠仗义；峨眉仙霞清柔真人，座下仙霞五奇，四处除魔卫道；得道高僧千叶禅师，广纳门徒，传道布施，救灾救人；是合作？是冲突？正道之间暗藏危机……

魔长：锁妖塔崩毁，万千妖魔尽出；三魔器现世，人间再掀波澜；掌旗使孔璘，重整魔族势力；有阴谋？有意图？最大灾祸即将降临……

乱世情：长大后的王小虎，踏入这纷乱的江湖，个性正直的他，会与可爱的忆如、美艳的苏媚以及清丽的欺霜，交织出怎样的一个故事呢？

《仙剑奇侠传三》的剧情发生在初代的五十年前。

渝州最大当铺──永安当的伙计景天每日幻想能富甲天下或成为蜀山剑仙，认识了当铺主人唐家堡的大小姐雪见。同雪见、雪见的宠物五毒兽花楹展开冒险。在结识蜀山派弃徒徐长卿及其恋人紫萱后，开始为协助蜀山找寻失散各地的五颗灵珠。另一方面爱慕紫萱的魔尊重楼与景天前世神界神将飞蓬惺惺相惜，为助景天而交予他其另一前世姜国王子龙阳所铸魔剑。景天又遇到剑中宿灵的龙阳妹妹龙葵。在与主要敌人邪剑仙的纠缠斗争中，冒险完全展开。

《仙剑奇侠传三外传·问情篇》的故事发生在三代的十多年后、初代的三十多年前。问情篇的剧情在仙剑系列中的主要作用，是连接三代和初代的剧情。在问情篇中，三代的主角及初代的重要角色都有在主线或分支中客串。

由于未知的原因，蜀山仙境开始崩坏，掌门徐长卿命南宫煌寻找清冷真人并取得丢失多年的蜀山秘宝五灵轮，由此南宫煌展开了一系列奇妙的地脉之旅。南宫煌也由此结识了温慧、王蓬絮、星璇、雷元戈等几位好友，更发现在这灾难背后，居然隐藏着不为人知的创世天道与宿命悲情……

《仙剑奇侠传四》的故事发生在三代的数百年前。

山野少年云天河从小孤独地成长，整天以玩猪、猎猪为乐。某日因盗墓少女韩菱纱而闯入父母的神秘墓室，墓室中的奇事奇景使得少年踏上了寻觅往事、求仙问道的旅途。

在寻仙的过程中结识了天仙般美貌的官家千金柳梦璃、拥有剑仙般浩然正气的慕容紫英。随着那掩埋在岁月风沙之下的往事日渐清晰，山野少年尝尽红尘俗世的喜怒哀乐与悲欢离合，他逐渐渴望重新回到往日无忧无虑的日子。

《仙剑奇侠传五》的故事发生在初代的三十多年后。

在山寨中长大的姜云凡，原是不知天高地厚的轻狂少年，然而苍木山上，当他踏出山门那刻起，便已踏上命中注定的长旅。

温柔大小姐唐雨柔，精灵苗疆女小蛮，神秘贵公子龙幽……邂逅的是宿世因缘，抑或命运作弄？

蜀山剑仙，武林世家，妖魔邪异……变幻的是沧桑世事，抑或百态人心？

锁妖塔下，神魔之井……掩埋的是前尘过往，抑或汹涌暗流？

而当漫长的追寻到达终点，所求为何，所得，又是如何？

遗憾，完满……破灭，救赎……诀别，约定……聚散离合，白云苍狗，三尺霜刃，十丈红尘，仙剑奇侠，再续仙缘。

每一部剧情是没有联系的